تمنح الكلية درجة الماجستير ودرجة الدكتوراة في التخصصات التالية:
- نظم المعلومات
- نظم الحاسبات
- الحسابات العلمية
- علوم الحاسب
- المعلوماتية الحيوية
- هندسة البرمجيات
الماجستير/ الدكتوراة في علوم الحاسبات والمعلومات – تخصص علوم حاسب
الماجستير/ الدكتوراة في علوم الحاسبات والمعلومات – تخصص نظم معلومات
الماجستير/ الدكتوراة في علوم الحاسبات والمعلومات – تخصص حسابات علمية
الماجستير/ الدكتوراة في علوم الحاسبات والمعلومات – تخصص نظم حاسبات